Агрессоры могут устанавливать прямой силовой и административный контроль над местными религиозными институтами, лишая их канонической независимости и подчиняя своим духовным центрам. Ликвидация независимой юрисдикции позволяет устранить авторитетные национальные институты (захват управления) и использовать религиозный аппарат для долгосрочного навязывания лояльности и идеологического закрепления оккупации.
Ликвидация независимой юрисдикции для превращения церкви в инструмент ассимиляции – присоединение украинской церкви к московской в 1686 году[1]. Вселенский патриархат впоследствии официально констатировал, что эти действия «были совершены совсем не в согласии с законными каноническими предписаниями»[2].
Ликвидация независимой духовной структуры на Правобережье в 1839 году: «в связи с ликвидацией царатом унии в этом регионе (1839) монастырь был закрыт, а его строения уничтожены»[3].
Колонизатор отбирал у чеченских священнослужителей пожертвования прихожан и закрывал их храмы. Осенью 1929 года в Гойтах колонизаторы отбирали мечеть за невыполненное «хлебное задание» - норму сдачи зерна империи; об этом говорил предводитель восстания в Шали Шита Истамулов: «Смотрите, какое безобразие творят в Гойтах; объявили пока хлеб не выполните, на это время отберем мечеть. Куда же это дело годится, когда у чеченского народа отбирают его последнюю веру…»[4]. Историки Я. З. Ахмадов и Э. Х. Хасмагомадов пишут, что в 1929 году в Надтеречном районе «начинается эксперимент по отстранению мулл от распределения добровольных пожертвований мусульман в пользу бедных и духовенства — закята» - империя передала раздачу своим комитетам крестьянской взаимопомощи[5]. Колонизатор уничтожил большую часть мечетей Чечни - счёт до и после у историка К. Г. Дендиева: до российской революции в Чечне было «2675 мечетей, 60 тыс. мюридов [учеников шейхов], членов различных религиозных организаций, 38 шейхов, 850 мулл и 140 духовных школ», - а счёт середины 1937 года: «401 мечеть, не считая кубовых [малых квартальных]», при которых «работали 406 мулл»[4]. Командующий оккупационными войсками Северо-Кавказского военного округа Белов в докладе командования округа краевому комитету партии («Северо-Кавказский крайком ВКП(б)») об итогах войсковой операции весны 1930 года назвал закрытие мечетей по приказам колонизаторов среди причин, по которым чеченские аулы поднялись с оружием[6].
Массовое закрытие и разрушение церквей, а также репрессии против священнослужителей с целью полного разгрома Украинской автокефальной православной церкви (УАПЦ)[7].